Одно из основных направлений деятельности института — селекция зерновых и кормовых культур. Достижения в данной области — селекционерами института создано более ста сортов различных культур, которые характеризуются высоким генетическим потенциалом продуктивности, скороспелостью, устойчивостью к стрессам и способны давать продукцию хорошего качества.
В 1970 году при СибНИИСХозе создан Западно-Сибирский селекционный центр.